L’habitat dans les cours d’eau peut être influencé par la qualité de l’eau, la profondeur, la largeur et la vélocité du cours d’eau, la température et la sédimentation, ainsi que par le substrat et d’un passage. Le saumon a besoin de conditions précises dans le cours d’eau afin de frayer avec succès et survivre comme alevin, tacon, saumoneau et saumon adulte. Que ce soit la température de l’eau ou l’envasement dans l’eau – tous les aspects de l’habitat sont importants.